Durante muchos años los usuarios finales, los administradores y operadores del AS400 han trabajado exclusivamente con las aplicaciones y objetos contenidos en el file system QSYS.LIB, con su estructura "tradicional" jerárquica de Bibliotecas, Objetos y Miembros.

Sin embargo en los últimos años se "popularizó" el uso de otros sistemas de archivo "no-nativos" disponibles en un sistema AS400, conocido como el Sistema de Archivos Integrado (Integrated File System o IFS), debido a que posibilita almacenar no sólo elementos "tradicionales" dentro del File System QSYS.LIB (código EBCDIC), sino también contenido ASCII: archivos de texto, scripts SQL, documentos, planillas de cálculo y páginas HTML, así como videos, imágenes y archivos de audio, permitiendo la integración y el intercambio de información con las plataformas Windows, Unix y Linux

Es importante aclarar que el IFS no es un sistema operativo ni un programa bajo licencia (tampoco se lo encontrará como opción separada de ningún producto) simplemente forma parte del sistema operativo.

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